O Everton começou em 1878 como St. Domingo's, uma equipe ligada a uma capela metodista. O futebol mantinha seus integrantes ativos durante o inverno, entre as temporadas de críquete. Em 1888, participou da fundação da Football League e, três anos depois, conquistou o primeiro Campeonato Inglês. A continuidade na primeira divisão se tornaria uma de suas características mais fortes, com apenas quatro temporadas fora dela ao longo da história.
A chegada de Dixie Dean em 1925 marcou outra fase de sucesso. Seus sessenta gols na liga de 1927-28 acompanharam um título nacional e estabeleceram uma marca histórica. Mesmo o rebaixamento de 1930 foi breve: o Everton voltou imediatamente e foi campeão inglês em 1932. A conquista de 1939 confirmou a força do clube antes da interrupção causada pela Segunda Guerra.
Nos anos 1980, Howard Kendall comandou um novo período de destaque. O Everton ganhou a Copa da Inglaterra de 1984, dois campeonatos ingleses e a Recopa Europeia de 1985, seu primeiro troféu continental. A derrota na final da Copa da Inglaterra daquele ano impediu que somasse três grandes títulos na mesma temporada, mas não reduziu a importância da geração.
A Copa da Inglaterra de 1995, vencida contra o Manchester United com Joe Royle, tornou-se o último troféu de um período prolongado. David Moyes levou o time a outra final em 2009, sem encerrar a espera. A entrada de Farhad Moshiri como acionista em 2016 aumentou os gastos, mas não trouxe resultados equivalentes. Os prejuízos também geraram processos e punições por descumprimento das regras financeiras da Premier League.
O Friedkin Group assumiu o controle em dezembro de 2024 e trouxe Moyes de volta no mês seguinte. A temporada de 2025-26 teve outra mudança importante: depois de jogar em Goodison Park desde 1892, o Everton passou para o novo estádio em Bramley-Moore Dock. O décimo terceiro lugar na liga mostrou que a renovação da estrutura ainda não significava uma volta às disputas por títulos. O clube iniciou essa etapa tentando aproximar sua capacidade atual da tradição construída em mais de um século de elite.