O Atlético de Madrid nasceu em 1903 como uma filial do Athletic de Bilbao, criada por estudantes bascos que moravam na capital. A separação aconteceu nos anos 1920, quando o clube passou a construir uma trajetória própria. Depois da Guerra Civil, com dificuldades financeiras e falta de jogadores, associou-se à equipe da aviação militar e adotou o nome Athletic Aviación. O nome Atlético de Madrid veio em 1947.
Os estádios acompanharam seu crescimento. O antigo Metropolitano recebeu o time a partir de 1923, e o estádio do Manzanares, depois chamado Vicente Calderón, foi inaugurado em 1966. Naquele campo, o Atlético consolidou parte importante de sua relação com a torcida antes da mudança para o novo Metropolitano, em 2017.
As conquistas internacionais começaram com a Recopa de 1962. Em 1974, o clube chegou à final da Copa dos Campeões e esteve perto de vencer o Bayern de Munique, mas sofreu o empate no fim da prorrogação e perdeu o jogo de desempate. Como o Bayern recusou disputar a Copa Intercontinental, o Atlético ocupou sua vaga e conquistou o troféu contra o Independiente.
O período de Jesús Gil na presidência misturou sucesso esportivo e graves problemas administrativos. Com Radomir Antić, o time ganhou campeonato e Copa do Rei em 1996. Poucos anos depois, uma intervenção judicial afastou a diretoria, e a temporada terminou com o rebaixamento de 2000. O retorno à elite veio em 2002, após dois anos na segunda divisão.
Diego Simeone, antigo jogador do clube, assumiu o comando técnico em dezembro de 2011 e iniciou um longo ciclo de títulos. Vieram duas Ligas Europa, a Copa do Rei de 2013 e os campeonatos espanhóis de 2014 e 2021. O Atlético voltou a disputar a principal competição europeia até a decisão, mas perdeu as finais de 2014 e 2016 para o Real Madrid.
Esse período recolocou o clube entre os protagonistas espanhóis e europeus, embora a Liga dos Campeões continuasse sem ser conquistada. A expansão também trouxe investimentos elevados e contratações de grande custo, nem sempre correspondidos em campo. Em 2026, a compra do controle pela Apollo Sports Capital abriu uma nova etapa administrativa, com Enrique Cerezo e Miguel Ángel Gil Marín ainda em funções de direção.